Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TrabdQ99JY4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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