Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp3Q91W36 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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