Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms