Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Uhrf1Q8VDF2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Uhrf1Q8VDF2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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