Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ttc8Q8VD72 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ttc8Q8VD72 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc8Q8VD72 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc8Q8VD72 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc8Q8VD72 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc8Q8VD72 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc8Q8VD72 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc8Q8VD72 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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