Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf183Q8QZS5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms