Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c1Q8K284 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c1Q8K284 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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