Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trip10Q8CJ53 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms