Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGW4

Sox30, Transcription factor SOX-30, mousemouse

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox30Q8CGW4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sox30Q8CGW4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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