Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nhlrc3Q8CCH2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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