Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ephb1Q8CBF3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ephb1Q8CBF3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms