Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC106179Q8C9L1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC106179Q8C9L1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
BC106179Q8C9L1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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BC106179Q8C9L1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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