Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rufy1Q8BIJ7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms