Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cyp4f39Q8BGU0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms