Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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