Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rims3Q80U57 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rims3Q80U57 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rims3Q80U57 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms