Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ifna12Q80SS5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ifna12Q80SS5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms