Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms