Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms