Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smchd1Q6P5D8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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