Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CltbQ6IRU5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CltbQ6IRU5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms