Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntn4Q69Z26 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms