Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PcolceQ61398 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PcolceQ61398 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PcolceQ61398 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PcolceQ61398 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PcolceQ61398 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PcolceQ61398 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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