Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Foxd1Q61345 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxd1Q61345 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxd1Q61345 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms