Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cln3Q61124 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cln3Q61124 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Cln3Q61124 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cln3Q61124 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms