Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc6a4Q60857 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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