Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim38Q5SZ99 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim38Q5SZ99 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim38Q5SZ99 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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