Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim41Q5NCC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms