Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrc47Q505F5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc47Q505F5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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