Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trp53i11Q4QQM4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms