Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syne3Q4FZC9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syne3Q4FZC9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms