Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zmat1Q3V0C1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zmat1Q3V0C1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms