Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn13Q3UW68 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms