Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp19Q3UJD6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms