Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf180Q3U827 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf180Q3U827 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms