Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrc28Q3TX51 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lrrc28Q3TX51 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lrrc28Q3TX51 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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