Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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