Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc13Q3TIR1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms