Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Treml4Q3LRV9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Treml4Q3LRV9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms