Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ptchd1Q14B62 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ptchd1Q14B62 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ptchd1Q14B62 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ptchd1Q14B62 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ptchd1Q14B62 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ptchd1Q14B62 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ptchd1Q14B62 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ptchd1Q14B62 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ptchd1Q14B62 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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