Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Traf3ip1Q149C2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Traf3ip1Q149C2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Traf3ip1Q149C2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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