Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp2b3Q0VF55 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms