Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrriq1Q0P5X1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrriq1Q0P5X1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms