Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnma1Q08460 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms