Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfiaQ02780 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfiaQ02780 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms