Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gjb4Q02738 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms