Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PrcdQ00LT2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms