Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pitx2P97474 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pitx2P97474 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms