Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkp1P97350 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp1P97350 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms