Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms